Математическая биология. Пространственные модели и их приложения в биомедицине. Том 2

Математическая биология. Пространственные модели и их приложения в биомедицине. Том 2
Мюррей Дж. Серия Математическая биология, биофизика ISBN 978-5-93972-882-9 Издательство «РХД» 2011 г.
Обложка, 1 104 стр.
Формат 60*84 1/16
Вес  1350 г

Аннотация

Настоящая книга представляет собой второй том знаменитого издания Джеймса Мюррея по математической биологии, которое выдержало за рубежом несколько изданий. В ней изложены захватывающие проблемы, возникающие в биомедицинских науках, и обозначен широкий спектр вопросов, эффективное изучение которых возможно при помощи математического моделирования. Во втором томе Мюррей останавливается более подробно на таких вопросах, как моделирование динамики брачных взаимоотношений, рост раковых опухолей, температуро-чувствительное формирование пола, территориальность волков, взаимодействие волков с оленями и выживание и т. д., и вводит новые приложения. В книге также рассматриваются базовые концепции моделирования, даются справочный материал и ссылки на дополнительную литературу. Большое внимание уделено обсуждению связей между моделями и экспериментальными данными.
Данная книга вкупе с первым томом вводит в область теоретической и математической биологии и представляет собой прекрасную основу для междисциплинарных исследований в области биологических и медицинских наук.

Содержание

Предисловие к третьему изданию
Предисловие к первому изданию

ГЛАВА 1. Многокомпонентные волны и практические области применения

1.1. Интуитивные ожидания
1.2. Волны погони и бегства в системах «хищник—жертва»
1.3. Модель конкуренции за пространственное распространение серой белки в Британии
1.4. Распространение организмов, созданных методами генной инженерии
1.5. Бегущий фронт волны в реакции Белоусова-Жаботинского
1.6. Волны в возбудимых средах
1.7. Бегущие волновые пакеты в системах реакций с диффузией и колебательной кинетикой
1.8. Спиральные волны
1.9. Решения со спиральными волнами в системах реакций с диффузией типа λ — ω
Упражнения

ГЛАВА 2. Формирование пространственных структур в реакционно-диффузионных системах
2.1. Роль пространственных структур в биологии
2.2. Диффузионно-реакционные механизмы (по Тьюрингу)
2.3. Общие условия диффузионной неустойчивости: линейный анализ устойчивости и эволюция пространственной структуры
2.4. Подробный анализ реакционно-диффузионного механизма зарождения структуры
2.5. Дисперсионное отношение, тьюрингово пространство
2.6. Селекция мод и дисперсионное отношение
2.7. Образование структур в однокомпонентной модели: пространственная неоднородность в модели почкоеда
2.8. Пространственные структуры в скалярных моделях взаимодействия популяций с диффузией и адвекцией: стратегии экологического контроля
2.9. Отсутствие пространственных структур в системах реакций с диффузией: общие и частные результаты
Упражнения

ГЛАВА 3. Окраска шкур животных и другие практические приложения реакционно-диффузионных механизмов
3.1. Окраска шкур млекопитающих — «Как леопард получил свои пятна»
3.2. Тератология: примеры аномального окраса животных
3.3. Механизм формирования окраски крыльев бабочки
3.4. Моделирование структуры, образуемой волосками в мутовке Acetabularia

ГЛАВА 4. Формирование структур в растущих областях: аллигаторы и змеи
4.1. Формирование полосатых структур у аллигаторов: эксперименты
4.2. Модельный подход: определение времени формирования полос
4.3. Полосы и теневые полосы на коже аллигатора
4.4. Структурообразование при формировании зубов аллигатора: предпосылки и актуальность проблемы
4.5. Биология закладки зубов
4.6. Моделирование закладки зачатков зубов: предпосылки
4.7. Модельный механизм структурообразования при закладке зубов аллигатора
4.8. Результаты и сравнение с экспериментальными данными
4.9. Предсказания на основе численных экспериментов
4.10. Заключительные замечания о структурообразовании при закладке зубов аллигатора
4.11. Формирование пигментных узоров на коже змей
4.12. Модельный механизм клеточного хемотаксиса
4.13. Простые и сложные элементы узора кожи змей
4.14. Распространение узора в системе клеточного хемотаксиса

ГЛАВА 5. Бактериальные пространственные структуры и хемотаксис
5.1. Предпосылки и экспериментальные результаты
5.2. Механизм моделирования экспериментов с E. coli на полутвердой среде
5.3. Модель жидкой фазы: интуитивный анализ формирования пространственных структур
5.4. Интерпретация аналитических результатов и численных решений
5.5. Модель полутвердой фазы для S. Typhimurium
5.6. Линейный анализ базовой модели полутвердой фазы
5.7. Краткое описание и результаты нелинейного анализа
5.8. Результаты моделирования, параметрические пространства, базовые структуры
5.9. Численные результаты для экспериментальных начальных условий
5.10. Возникновение пространственных структур в виде концентрических колец в модели экспериментов на полутвердой среде
5.11. Ветвистые структуры, образуемые Bacillus subtilis

ГЛАВА 6. Механическая теория образования структур и форм в процессе развития
6.1. Введение, мотивация и биологические предпосылки
6.2. Механическая модель мезенхимального морфогенеза
6.3. Линейный анализ, дисперсионное уравнение и способность к формированию пространственных структур
6.4. Простые механические модели со сложными дисперсионными соотношениями, порождающие пространственные структуры
6.5. Периодические структуры зачатков перьев
6.6. Формирование хрящевой ткани в морфогенезе конечностей и правила морфогенеза
6.7. Формирование отпечатков пальцев у эмбриона
6.8. Механохимическая модель для эпидермиса
6.9. Формирование микроворсинок
6.10. Формирование сложных пространственных структур и модели взаимодействия тканей
Упражнения

ГЛАВА 7. Эволюция, законы морфогенеза, ограничения развития и тератология
7.1. Эволюция и морфогенез
7.2. Эволюция и морфогенетические правила формирования хряща в конечностях позвоночных
7.3. Тератология (Чудовища)
7.4. Ограничения развития, правила морфогенеза и последствия эволюции

ГЛАВА 8. Механическая теория формирования сети сосудов
8.1. Биологические предпосылки и мотивация
8.2. Взаимодействие клеток и внеклеточного матрикса при васкулогенезе
8.3. Значения параметров
8.4. Анализ уравнений модели
8.5. Структуры сети сосудов: численные эксперименты и выводы

ГЛАВА 9. Заживление повреждений эпидермиса
9.1. Краткая история заживления ран
9.2. Биологические предпосылки: раны эпидермиса
9.3. Модель заживления повреждений эпидермиса
9.4. Безразмерный вид, линейная устойчивость и значения параметров
9.5. Численные решения для модели заживления раны эпидермиса
9.6. Решения с бегущими волнами для эпидермальной модели
9.7. Медицинские следствия модели повреждения эпидермиса
9.8. Механизмы заживления ран эпидермиса у эмбрионов
9.9. Полимеризация актина при повреждении эмбриона: механическая модель
9.10. Двумерная механическая модель перестройки актиновых филаментов под действием напряжения

ГЛАВА 10. Заживление проникающих ран
10.1. Предпосылки и мотивация — общие и биологические
10.2. Логика заживления ран и исходные модели
10.3. Краткое описание более поздних разработок
10.4. Модель движимого фибробластами заживления ран: остаточные деформации и перестройка тканей
10.5. Решения модельных уравнений и сравнение с экспериментом
10.6. Модель заживления ран Cook (1995)
10.7. Секреция и деградация матрикса
10.8. Движение клеток в ориентированной среде
10.9. Модельная система заживления проникающих ран, учитывающая структуру ткани
10.10. Одномерная модель структуры патологических рубцов
10.11. Нерешенные проблемы заживления ран
10.12. Заключительные замечания о заживлении ран

ГЛАВА 11. Рост и регуляция опухолей мозга
11.1. Медицинские предпосылки
11.2. Базовая математическая модель роста и инвазии глиомы
11.3. Распространение опухоли in vitro: Оценка параметров
11.4. Инвазия опухоли в мозге крысы
11.5. Инвазия опухоли в человеческом ммозге
11.6. Модельные сценарии лечения: Общие замечания
11.7. Моделирование резекции опухоли в однородной ткани
11.8. Аналитическое решение для рецидива опухоли после резекции
11.9. Моделирование хирургической резекции при неоднородности ткани мозга
11.10. Моделирование влияния химиотерапии на рост опухоли
11.11. Моделирование поликлональности и клеточных мутаций опухоли

ГЛАВА 12. Нейронные модели формирования пространственных структур
12.1. Описание пространственных структур при генерации импульса нейроном при помощи простой модели активации-ингибирования
12.2. Механизм формирования полос в зрительной коре
12.3. Модель механизмов мозга, определяющих пространственные структуры галлюцинаций
12.4. Модель нейронной активности для узоров раковин моллюсков
12.5. Шаманизм и наскальная живопись
Упражнения

ГЛАВА 13. Географическое распространение и контроль эпидемий
13.1. Простая модель пространственного распространения эпидемии
13.2. Распространение «Черной смерти» в Европе в 1347-1350 годах
13.3. Краткая история бешенства: Факты и мифы
13.4. Пространственное распространение бешенства среди лисиц I: Предпосылки и простая модель
13.5. Пространственное распространение бешенства среди лисиц II: Трехкомпонентная (SIR) модель
13.6. Стратегии контроля, основанные на распространении волны в свободную от эпидемии область: Оценка ширины барьера против бешенства
13.7. Аналитическое приближение ширины контролирующего барьера против бешенства
13.8. Двумерные фронты эпизоотии и влияние различий плотности лисиц: Количественные предсказания для вспышки бешенства в Англии
13.9. Влияние иммунитета лисиц на пространственное распространение бешенства
Упражнения

ГЛАВА 14. Территориальность волков, взаимодействие между волками и оленями и выживание
14.1. Введение и экология волков
14.2. Модели формирования территории волчьей стаи: Модель «Одна стая-индивидуальный участок»
14.3. Территориальная модель для нескольких волчьих стай
14.4. Модель «хищник-жертва» для волков и оленей
14.5. Заключительные замечания о территориальности волков и выживании оленей
14.6. Пространственная структура индивидуальных участков койотов
14.7. Конфликт между племенами Чиппева и Сиу в 1750-1850 годах

ПРИЛОЖЕНИЕ A. Общие результаты для оператора Лапласа в ограниченных областях
Литература
Предметный указатель
Именной указатель