Аннотация
Предлагаемая книга отражает современное состояние сравнительно новой, но весьма важной и стремительно развивающейся области науки, находящейся на стыке молекулярной биологии и генетики, математики (статистики и теории вероятностей) и информатики. Впервые предпринимается попытка представить научный обзор известных на сегодняшний день методов анализа биологических последовательностей, особое внимание уделяется вероятностному моделированию. Подробно рассматриваются скрытые модели Маркова, профильные исследования, анализ вторичной структуры РНК, филогенетический анализ, парное и многомерное выравнивание.
Поскольку книга носит междисциплинарный характер, она будет интересна широкому кругу специалистов в области молекулярной биологии, информатики и математики.
Содержание
Предисловие к русскому изданию
Предисловие
Глава 1. Введени
Глава 2. Выравнивание двух последовательностей
Глава 3. Цепи Маркова и скрытые марковские модели
Глава 4. Парное выравнивание с помощью НММ
Глава 5. Применение профильных НММ к семействам последовательностей
Глава 6. Методы множественного выравнивания последовательностей
Глава 7. Построение филогенетических деревьев
Глава 8. Вероятностные подходы к филогении
Глава 9. Трансформационные грамматики
Глава 10. Анализ структуры РНК
Глава 11. Сведения из теории вероятностей
Список литературы
Предметный указатель