Биофизика: в 3-х томах. Том 3. Биофизика клеточных процессов. Механизмы первичных фотобиологических процессов

Биофизика: в 3-х томах. Том 3. Биофизика клеточных процессов. Механизмы первичных фотобиологических процессов
Рубин А.Б. Серия Математическая биология, биофизика ISBN 978-5-4344-0103-6 Издательство «ИКИ» 2013 г.
Переплет, 480 стр.
Формат 70*100 1/16
Вес  1000 г

Аннотация

Предлагаемая книга представляет собой фундаментальный учебник по биофизике, в котором излагаются основы современной биофизической науки.
В третий том учебника «Биофизика клеточных процессов. Механизмы первичных фотобиологических процессов» включены главы, касающиеся электронных свойств биополимеров, представления о физических механизмах переноса электронов в биологических структурах, в которых прочно утвердились идеи об активной роли белка в механизмах и путях транспорта электронов. Рассматриваются механизмы первичных стадий фотобиологических процессов, в том числе фотосинтеза, зрения, фотохимических реакций в биополимерах.
Книга предназначена для широкого круга читателей разного профиля, включающего студентов и аспирантов, а также научных работников, которые интересуются фундаментальными проблемами современной физико-химической биологии. Предполагается, что читатель знаком с основами биологических дисциплин, физики, химии и математического анализа, которые читаются студентам биологических специальностей университетов России в рамках общих курсов на 1-3 годах обучения. Новые необходимые сведения по физике и математике приводятся по ходу изложения основного материала книги.

Рекомендовано Учебно-методическим объединением по классическому университетскому образованию в качестве учебника для студентов высших учебных заведений, обучающихся по направлению 020400 (020200) «Биология» и специальности 020207 «Биофизика»

Содержание

Раздел VIII. Электронные свойства биополимеров
ГЛАВА 24. Основы квантового описания молекул

§ 1. Введение
§ 2. Стационарные и нестационарные состояния квантовых систем. Принцип суперпозиции состояний
2.1. Гармонический осциллятор
2.2. Нормальные координаты и нормальные частоты системы связанных осцилляторов
§ 3. Стационарная теория возмущений
§ 4. Нестационарная теория возмущений — теория переходов
§ 5. Модель иона молекулы водорода. Природа химической связи
§ 6. Вариационный метод нахождения стационарных состояний
§ 7. Метод молекулярных орбиталей
§ 8. Проявление электронных свойств биополимеров
§ 9. Оптическая активность биополимеров

ГЛАВА 25. Механизмы переноса заряда и миграции энергии в биомолекулярных структурах
§ 1. Туннельный эффект
1.1. Квазиклассическое приближение. Формула Гамова
1.2. Расчет прозрачности потенциальных барьеров различной формы: прямоугольной, треугольной, параболической
1.3. Адиабатическое приближение
§ 2. Теория переноса заряда
2.1. Формулировка проблемы. Локализованные состояния
2.2. Электрон-колебательные взаимодействия
2.3. Распад возбужденного состояния квантовых систем
2.4. Анализ температурной зависимости скорости реакции электронного переноса
2.5. Общий анализ формул Джортнера и Маркуса
2.6. Электронный матричный элемент V’e
2.7. Применение теории электронного переноса к биологическим системам
§ 3. Роль водородных связей в процессах электронного транспорта в биомолекулярных системах
3.1. Изменение локального электростатического потенциала при переносе протона вдоль линии водородной связи
3.2. Туннелирование протона в двухъямном потенциале (вычисление k0)
3.3. Деформация водородной связи
3.4. Деформация водородных связей и конформационная динамика белка
3.5. Анализ температурной зависимости величин τ, ϕ и Δϕ
3.6. Температурная зависимость разности свободной энергии
§ 4. Современное состояние теории электронного переноса в конденсированных средах (проблемы и перспективы)
§ 5. Динамика фотоконформационного перехода
§ 6. Индуктивно-резонансный механизм
§ 7. Обменно-резонансный перенос энерги
§ 8. Экситонный механизм

ГЛАВА 26. Механизмы ферментативного катализа
§ 1. Физико-химическое описание и биофизические модели ферментативных процессов
§ 2. Электронно-конформационные взаимодействия в ферментативном катализе
§ 3. Динамика фермент-субстратных взаимодействий
§ 4. Электронные взаимодействия в активном центре фермента
§ 5. Молекулярное моделирование структуры фермент-субстратного комплекса

Часть IV. Биофизика фотобиологических процессов

Раздел IX. Первичные процессы фотосинтеза
ГЛАВА 27. Трансформация энергии в первичных процессах фотосинтеза

§ 1. Общая характеристика начальных стадий фотобиологических процессов
§ 2. Общая схема первичных процессов фотосинтеза
§ 3. Структурная организация пигмент-белковых комплексов антенны
§ 4. Механизмы трансформации энергии возбуждения в фотосинтетической мембране
§ 5. Реакционные центры пурпурных фотосинтезирующих бактерий
§ 6. Пигмент-белковый комплекс фотосистемы I
§ 7. Пигмент-белковый комплекс фотосистемы II
§ 8. Переменная и замедленная флуоресценция

ГЛАВА 28. Электронно-конформационные взаимодействия в первичных процессах фотосинтеза
§ 1. Мeтоды лазерной спектроскопии
§ 2. Исследование сверхбыстрых процессов в реакционных центрах фотосинтеза
§ 3. Начальное разделение зарядов в РЦ
§ 4. Механизмы окисления цитохрома в реакционных центрах
§ 5. Конформационная динамика и перенос электрона в реакционных центрах
§ 6. Перенос электронов и формирование контактных состояний в системе хинонных акцепторов (PQAQB)
§ 7. Математические модели первичных процессов переноса электрона в фотосинтезе

Раздел X. Первичные фотопроцессы в биологических системах
ГЛАВА 29. Фотопревращения бактериородопсина и родопсина

§ 1. Структура и функции пурпурных мембран
§ 2. Фотоцикл бактериородопсина
§ 3. Первичный акт фотопревращений бактериородопсина
§ 4. Модельные системы, содержащие бактериородопсин
§ 5. Молекулярные основы зрительной рецепции. Зрительные клетки (палочки)
§ 6. Фотохимический цикл родопсина
§ 7. Первичный акт фотопревращения родопсина

ГЛАВА 30. Фоторегуляторные и фотодеструктивные процессы
§ 1. Общая характеристика фоторегуляторных процессов
§ 2. Фоторецепторы и молекулярные механизмы процессов фоторегуляции Фитохромы
§ 3. Общая характеристика фотодеструктивных процессов
§ 4. Фотохимические реакции в ДНК и ее компонентах
§ 5. Особенности действия высокоинтенсивного лазерного УФ-излучения на ДНК (двухквантовые реакции)
§ 6. Фотореактивация и фотозащита
§ 7. Действие ультрафиолетового света на белки
§ 8. Сенсибилизированное повреждение биомолекул в фотодинамических реакциях
§ 9. Фотосенсибилизированные эффекты в клеточных системах

Рекомендуемая литература
Предметный указатель